組裝它

Juicer

本文主要介紹了Juicer程序，它是一款用于處理HiC數(shù)據(jù)的工具，能夠進行Loop-Resolution分析。

Juicer具有一鍵式分析功能，能夠自動注釋Loops和Domains，處理terabase規(guī)模的Hi-C數(shù)據(jù)集。

Juicer是一款開源程序，兼容多個集群操作系統(tǒng)和Amazon Web Services。

安裝Juicer需要在Windows、Linux和Mac OSX上安裝有效的Java（版本 >= 1.8）、GNU CoreUtils和Burrows-Wheeler Aligner (BWA)。

在Ubuntu系統(tǒng)上安裝Juicer時，需要創(chuàng)建Juice目錄、參考基因組相關文件目錄、樣本的序列文件和分析結果目錄以及參考基因組酶切圖譜目錄。

安裝Juicer時需要注意，建議下載Releases中的1.6版本，而不是使用git clone方式獲取最新版本，因為開發(fā)中的版本可能存在錯誤。

安裝Juicer時需要安裝bwa，可以通過conda創(chuàng)建環(huán)境并安裝bwa。

運行Juicer生成merged_nodups.txt文件，用于3D-DNA進行染色體掛載。

Juicer運行完成后會生成splits和aligned兩個目錄。splits目錄存放中間結果，而aligned目錄存放最終結果，包含可以導入juicebox的后綴為hic的圖譜文件。

"merged_nodups.txt"是下一步3D-DNA的輸入文件之一。

參考資料：

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1、車輛組裝實驗簡要評析：

2、車輛組裝實驗圖片欣賞：

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1、組裝鉆機簡要評析：

《組裝鉆機》給玩家?guī)砹朔浅＝鈮旱挠螒蛐Ч?。玩家需要在游戲中扮演工程師來完成組裝鉆頭的任務。游戲采用3D立體畫面，玩家可以真實感受到鉆機的裝配過程，是一款非常有趣的挑戰(zhàn)游戲。在裝配鉆機的過程中，必須注意各部分的位置和連接，否則鉆機可能無法正常工作。快來組裝鉆寶藏試試吧。

2、組裝鉆機圖片欣賞：

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1、零食組裝簡要評析：

零食組裝是款非常好玩的休閑闖關游戲，在零食組裝游戲中你需要將面前各種食物的組件進行拼裝，將各種部件放置到正確的地方，成功的組裝成完整的食物，每個關卡之中都有著一定的時間限制，你必須加快才能夠完成，對零食組裝這款游戲感興趣的同學們，歡迎來下載哦!

2、零食組裝圖片欣賞：

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¨組裝是游戲中獲得戰(zhàn)車的重要來源。通過組裝，玩家可以獲得更多、更強大的戰(zhàn)車，從而擴張自己的軍隊，以更加輕松的姿態(tài)對待敵人的攻擊。